植物葉綠體DNA提取試劑盒
產(chǎn)品編號
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產(chǎn)品名稱
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包裝
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RTU5003
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植物葉綠體DNA提取試劑盒
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50次
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● 產(chǎn)品簡介:
葉綠體(Chloroplast)是質(zhì)體的一種, 是高等植物和一些藻類所特有的能量轉(zhuǎn)換器,是光合作用的反應(yīng)場所。在高等植物中葉綠體為雙凸或平凸透鏡,長徑5~10μm,短徑2~4μm,厚2~3μm。高等植物的葉肉細(xì)胞一般含50~200個葉綠體,可占細(xì)胞質(zhì)的40%,葉綠體的數(shù)目因物種細(xì)胞類型,生態(tài)環(huán)境,生理狀態(tài)而有所不同。葉綠體由葉綠體外被(chloroplast envelope)、類囊體(thylakoid)和基質(zhì)(stroma)三部分組成,含有3種不同的膜:外膜、內(nèi)膜、類囊體膜和3種彼此分開的腔:膜間隙、基質(zhì)和類囊體腔。
葉綠體DNA(Chloroplast
DNA,cpDNA),存在于葉綠體內(nèi),高等植物葉綠體的DNA為雙鏈共價閉合環(huán)狀分子,其長度隨生物種類而不同,其大小在120 kb到217 kb之間,相當(dāng)于噬菌體基因組的大小雙鏈環(huán)狀,一個葉綠體含有10~50個cpDNA。
本試劑盒是結(jié)合植物葉綠體純化試劑盒和離心柱式植物DNA提取試劑盒而推出的新產(chǎn)品,專門用于植物葉綠體DNA的快速提取。
1.
純度高,不含污染和抑制劑,可以直接用于酶切、PCR、real-time
PCR、
multiplex PCR、RAPD、RFLP、AFLP、Southern
Blotting, microsatellite analysis等各種后續(xù)分子生物學(xué)實驗。
2.
以每次處理30
g葉片計算,本產(chǎn)品可使用8-10次提取植物葉綠體,每次能得到3-5
mg左右葉綠體。按照每次使用0.2
ml 葉綠體溶液計算,可以至少提取50次葉綠體DNA的純化。cpDNA
產(chǎn)率一般在1-2
μg/1 g葉片樣品。OD260/280一般在1.8以上。DNA片段長度一般在40-50
Kb左右。
3.
已經(jīng)成功用于菠菜,大豆,萵筍,白菜,煙草和甜菜等雙子葉植物,也適用于單子葉等其他植物(可能需要優(yōu)化條件)。
● 貯存及運輸:
4-8℃保存,至少一年有效;試劑盒常溫運輸。
● 產(chǎn)品組成:
產(chǎn)品貨號
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產(chǎn)品名稱
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包裝
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貯存
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RTU5003-01
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葉綠體提取緩沖液(5×)
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2×250
ml
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4-8℃
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RTU5003-02
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密度梯度分離試劑
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65
ml
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4-8℃
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RTU5003-03
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BSA
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3
g
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4-8℃
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RTU5003-04
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1
M DTT(粉末裝)
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2.5
ml
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4-8℃
配制后-20℃貯存
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RTU5003-05
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過濾紙
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50張/包
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RT
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RTU5003-06
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葉綠體DNA提取緩沖液AP1
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25
ml
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RT
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RTU5003-07
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葉綠體DNA提取緩沖液AP2
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10
ml
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RT
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RTU5003-08
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葉綠體DNA提取緩沖液AP3(濃縮液)
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15
ml
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RT
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PW-25ml
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漂洗液PW(濃縮液)
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25
ml
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RT
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RNaseA-0.5ml
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RNase A(10 mg/ml)
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0.5
ml
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-20℃
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EB-15ml
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洗脫緩沖液EB
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15
ml
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RT
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CG-50
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吸附柱CG(白色)
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50個/包
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RT
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CT-50
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收集管
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50個/包
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RT
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說明書
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一份
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-
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● 使用說明:
一 植物葉綠體提?。?span>
注意:葉綠體對溫度高度敏感,所以整個操作必須在冰上或者在冷室進(jìn)行,所用器皿和溶液均需要在4℃預(yù)冷。葉綠體提取過程中離心時一定要在4℃進(jìn)行,離心力以g而不是rpm計算。如果需要研究葉綠體的功能,提取過程還需要在昏暗的光線條件下進(jìn)行。
需要自備材料:
剪刀;50
ml尖底或圓底離心管;15
ml尖底或圓底離心管;漏斗;勻漿機;低溫離心機。
1.1 材料預(yù)處理:
實驗前1-2天將植物放在暗室培養(yǎng)以減少葉綠體中淀粉顆粒的形成,否則離心時這些顆粒很容易使葉綠體破裂。葉片在實驗前需先用自來水洗凈,再用蒸餾水淋洗,去掉多余水分。如果葉片采集后不能立即處理,則保存時需要保持葉片濕潤,即使如此,葉片采集后的放置時間也不能超過一天。
1.2
1×葉綠體提取緩沖液(即用型)配制:
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1×葉綠體提取緩沖液(即用型)
配制量200 ml
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葉綠體提取緩沖液(5×)
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40 ml
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BSA
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0.2 g
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1 M DTT
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200 μl
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滅菌水
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定容至200 ml
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冰上預(yù)冷待用,現(xiàn)用現(xiàn)配,不建議貯存
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注:一個30克樣品提取反應(yīng)需要 150 ml 1×葉綠體提取緩沖液(即用型)。
1.3 葉片勻漿:
1.3.1 新鮮采集植物葉片,快速去除葉脈(約30克)并將葉片剪成1-3 cm2大小的碎片并浸泡在150 ml的預(yù)冷的1×葉綠體提取緩沖液(即用型)中(每克葉片加5 ml)。
1.3.2 將浸泡了葉片的溶液轉(zhuǎn)移到勻漿機(貨號:RT-2243A)中,低速勻漿10秒,避免起泡沫。用玻璃棒把液面的碎片按入勻漿機底部后,再低速勻漿10秒,重復(fù)10秒勻漿3-4次至葉片破碎即可,不要過分勻漿,否則會降低完整葉綠體的得率。
1.3.3 用2層過濾紙置于小漏斗上,將勻漿液過濾收集到預(yù)冷的250 ml量筒中,一般更換三次濾紙可收集約120 ml濾液,將濾液等分到4個預(yù)冷的50 ml的塑料離心管中(每個管中的濾液不要超過35 ml)。
1.4 離心去雜質(zhì):
4℃ 200 g離心5分鐘,保留上清,沉淀為未破裂植物組織、細(xì)胞或細(xì)胞核(下圖);如果樣品中淀粉含量較高,沉淀可能為白色。
注:此步驟用低速離心去除雜質(zhì),不能省略,否則得到的葉綠體DNA中會有核基因組的污染。
1.5 收集葉綠體粗提液:
1.5.1將步驟1.4得到的上清液平分到4個預(yù)冷的50 ml塑料離心管中;4℃ 1100 g離心15分鐘,小心棄上清,沉淀含葉綠體,呈深綠色(下圖)。
1.5.2 在沉淀中加入1.5 ml 預(yù)冷的1×葉綠體提取緩沖液(即用型),手彈離心管底部使葉綠體重懸,收集4管溶液(約6 ml),此溶液即為葉綠體粗提產(chǎn)物。
1.5.3 如果對葉綠體DNA是否含細(xì)胞核DNA的要求不高,則葉綠體粗提液可以直接用于葉綠體DNA純化(步驟2.1)。
1.6 完整葉綠體的純化:
葉綠體重懸液配制
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葉綠體重懸液
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配制量20 ml
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葉綠體提取緩沖液(5×)
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4 ml
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滅菌水
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16 ml
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冰上預(yù)冷待用,現(xiàn)用現(xiàn)配,不建議貯存
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1.6.1 單梯度分離法(適合菠菜,白菜,萵苣,擬南芥,綠蘿等):
1.6.1.1 40%密度梯度液配制-10 ml:
在15 ml離心管中加入6 ml 1×葉綠體提取緩沖液(即用型)和4 ml密度梯度分離試劑,充分混合均勻,得40%密度梯度液,冰浴備用。
1.6.1.2將10 ml 40%密度梯度液平分到2個 15 ml離心管中,每管5 ml;將步驟1.5.2得到的葉綠體粗提液3 ml小心鋪在5 ml密度梯度液之上;另一管重復(fù)。(5 ml 40%密度梯度液用可以分離3 ml 葉綠體粗提液,其他體積以此比例換算)。
1.6.1.3 4℃ 3200 g離心30分鐘,綠色沉淀為完整葉綠體(下圖)。
注:如果最上層的分離試劑不夠清亮,可以延長離心20分鐘。
1.6.1.4 小心棄上清,保留沉淀,每管沉淀中加入1 ml 葉綠體重懸液,輕柔重懸,可以收集到2 ml完整葉綠體溶液。
1.6.1.5 此葉綠體溶液可以提取得到無細(xì)胞核DNA污染的葉綠體DNA
(步驟2.1)。
1.6.2雙梯度分離法(適合煙草,甜菜,豌豆等):
1.6.2.1 80%密度梯度重液配制-4 ml:
在15 ml離心管中加入0.8 ml 1×葉綠體提取緩沖液(即用型)和3.2 ml 密度梯度分離試劑,充分混合均勻,得80%密度梯度重液。
1.6.2.2 40%密度梯度輕液配制-8 ml:
在另一15 ml離心管加入4.8 ml 1×葉綠體提取緩沖液(即用型)和3.2 ml 密度梯度分離試劑,充分混合均勻,得40%密度梯度輕液。
1.6.2.3 取一只15 ml離心管,加入1.86 ml 80%密度梯度重液,隨后取3.74 ml 40%密度梯度輕液小心鋪在80%密度梯度重液之上,冰浴備用;然后取步驟1.5.2得到的3 ml葉綠體粗提液小心鋪在密度梯度輕液之上。另一管重復(fù)。
注:每5.6 ml
40%/80%密度梯度液可以分離3 ml 葉綠體粗提液;其他體積按照比例調(diào)整。
1.6.2.4 4℃ 3200 g離心30分鐘,上層綠色帶含破碎的葉綠體、線粒體和核糖體等,重液和輕液間的綠色帶為完整葉綠體(下圖)。
注:如果最上層的分離試劑不夠清亮,可以延長離心20分鐘。
1.6.2.5 重懸葉綠體:
用廣口吸管小心將重液和輕液之間的綠色帶(完整葉綠體)轉(zhuǎn) 移到新的15 ml離心管中,加入三倍體積預(yù)冷的葉綠體重懸液,輕柔混勻。
1.6.2.6 離心收集葉綠體:
4℃ 1750 g離心6分鐘,小心將上清倒出后,在綠色的葉綠體沉淀中加入預(yù)冷的1 ml葉綠體重懸液,手指輕彈管底使葉綠體重懸。最終可以收集到2
ml完整葉綠體溶液。
1.6.2.7此葉綠體溶液可以提取得到無細(xì)胞核DNA污染的葉綠體DNA(步驟2.1)。
1.7 葉綠體貯存:
葉綠體可在顯微鏡下檢查葉綠體完整性。葉綠體重懸液避光-80℃保存。葉綠體必須盡快使用,否則非常容易失去活性。
1.8 葉綠素含量測定:
通常葉綠體含量用單位葉綠素含量來表示,即x
mg 葉綠素/ml 葉綠體懸浮液。
1.8.1
取10 μl 葉綠體懸浮液加入到990
μl 80%丙酮溶液中,混勻。
1.8.2
3000 g 離心5分鐘,取上清測定OD652 吸光值,用80%丙酮做空白對照。
1.8.3
根據(jù)以下公式計算葉綠素:
葉綠素濃度(mg/ml)=(OD652×100)/36
100:稀釋倍數(shù)
36:extinction
coefficient in ml/cm·mg
二 葉綠體DNA提?。?/b>
注:以下離心操作可以常溫下進(jìn)行。
2.1
取0.2-0.4 ml葉綠體溶液,3500 g離心2分鐘,小心棄上清,沉淀為葉綠體。
注:可以根據(jù)提取的葉綠體濃度大體估算提取到的cpDNA濃度。經(jīng)驗值:每50
μg 葉綠體(葉綠素濃度)可以提取到1μg
cpDNA。
2.2葉綠體沉淀中加入400 μl 緩沖液AP1和6 μl RNaseA (10mg/ml),漩渦震蕩1分鐘。
2.3
將離心管放在65℃水浴10分鐘,水浴過程中顛倒離心管以混合樣品數(shù)次。
2.4
加入130 μl 緩沖液AP2,顛倒混勻,冰浴5分鐘。
2.5 12,000 rpm離心5分鐘,保留上清,上清通常為無色,沉淀為綠色。注:此步驟離心去除去垢劑,蛋白以及多糖等雜質(zhì)。
2.6 將上清(通常可取到400 μl)轉(zhuǎn)移到1.5 ml離心管中,加入1.5倍體積(例如400 μl的上清液加600 μl)緩沖液AP3(使用前請注意是否已經(jīng)加入無水乙醇),立即顛倒混勻,簡短離心以去除管蓋內(nèi)壁的水珠。
2.7吸取步驟2.6中的混合液加入到吸附柱CG中(吸附柱放入收集管中),12,000 rpm離心1分鐘,倒掉廢液,吸附柱CG放回收集管中。
注:離心吸附柱的最大容積是700 μl,如果一次不能完全上柱,可以分次上柱離心,保證全部溶液全部加到離心柱中。
2.8向吸附柱CG中加入700
μl漂洗液PW(使用前請先檢查是否已加入無水乙醇),12,000 rpm離心1分鐘,倒掉廢液,吸附柱CG放入收集管中。
2.9向吸附柱CG中加入500
μl漂洗液PW(使用前請先檢查是否已加入無水乙醇),12,000 rpm離心1分鐘,倒掉廢液,吸附柱CG放入收集管中。
2.10將吸附柱CG放回廢液收集管中,12,000 rpm離心2分鐘。
注:此步驟非常重要,目的是將吸附柱中殘余的漂洗液去除。漂洗液中乙醇的殘留會影響后續(xù)的酶反應(yīng)(酶切、PCR等)實驗。
2.11將吸附柱CG轉(zhuǎn)入一個干凈的1.5ml離心管中,向吸附膜的中間部位懸空滴加50-100
μl經(jīng)65℃水浴預(yù)熱的洗脫緩沖液EB,室溫放置2分鐘,12,000
rpm g離心2分鐘。
注:洗脫緩沖液體積不要少于50 μl,體積過小影響回收效率;洗脫液的pH值對于洗脫效率有很大影響。若用水做洗脫液應(yīng)保證其pH值在7.0-8.5范圍內(nèi),pH值低于7.0會降低洗脫效率。
2.12 葉綠體DNA產(chǎn)物-20℃保存。
三 實驗示例:
3.1 葉綠體提取示例:
30克綠蘿葉片,加入150
ml 1×葉綠體提取緩沖液(即用型) 勻漿5×10秒,3次過濾共收集120
ml過濾液,平分4管,4℃ 1100
g 離心15 min,棄上清,每管重懸于1.5
ml 1×葉綠體提取緩沖液(即用型)中,共得到6
ml 葉綠體粗提液。2×3
ml 粗提液平鋪于2×5
ml 40%密度梯度液之上,4℃ 3200 g離心15分鐘,棄上清,每管沉淀重懸于1 ml 葉綠體重懸液中,共得到2 ml精制葉綠體重懸液,測定葉綠素含量為3.43 mg/ml重懸液。30克葉片提取得到6.86 mg葉綠體。取10
μl葉綠體溶液稀釋20倍,取50 μl稀釋液顯微鏡40倍物鏡觀察,如下圖。
3.2 葉綠體DNA電泳示例:
葉綠體提取同3.1。取100 μl葉綠體重懸液,提取cpDNA,最后用50
μl洗脫,上樣5 μl,電泳結(jié)果見下圖左二泳道,cpDAN大小約20kb,無可見核基因組污染。